O exame bacteriológico pode ser realizado nos mais diversos materiais. Deve-se colher a amostra diretamente da lesão.

- Lesões profundas: realizar rigorosa antissepsia da região externa e puncionar com seringa e agulha.

- Fístulas e abscessos abertos: realizar rigorosa antissepsia da região externa e espremer o material da profundidade, colhendo a secreção com "swab" ou seringa.

- Ouvidos, Vagina: realizar rigorosa antissepsia da região externa e colher com "swab". Figura 1

- Sangue: Realizar tricotomia, antissepsia de pele, deixar secar. Se a coleta não for feita a vácuo proceder à desinfecção da tampa do frasco antes da inoculação de pelo menos 5 ml de sangue. Informar ao laboratório a suspeita diagnóstica. Os frascos para hemocultura devem ser solicitados ao laboratório antes da coleta.

- Urina: Para se fazer análise bacteriologia é importante que não haja nenhuma contaminação da amostra. Nunca colher com swab, pois inviabiliza a contagem de colônias.